Уголовное дело против него возбуждено по факту превышения должностных полномочий. Причиненный им ущерб оценивается в 131 миллион рублей. Следствие полагает, что Макаров присвоил себе полномочия вышестоящих должностных лиц правительства Москвы и предоставил ряду коммерческих организаций 50-процентную льготу при оплате за право размещения коммерческой рекламы. Ордер на арест столичного чиновника выдал Басманный районный суд Москвы.